Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Runx1Q03347 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms