Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SmsP97355 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SmsP97355 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms