Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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