Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Vmn2r-ps97-201ENSMUST00000222427 1970 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Evc-203ENSMUST00000114154 3695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm37302-201ENSMUST00000192958 2998 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Mc3r-201ENSMUST00000038532 2623 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Srgap2-204ENSMUST00000186543 3533 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Olfm4-203ENSMUST00000228749 2801 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Bcas1-203ENSMUST00000109152 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Ptpn7-202ENSMUST00000167080 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 B3gntl1-202ENSMUST00000067399 2864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Atg7-201ENSMUST00000032457 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Nkd1-202ENSMUST00000169179 4081 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm37039-201ENSMUST00000193733 2485 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Hk1-201ENSMUST00000072357 3639 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm35394-201ENSMUST00000196434 3252 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Gm37798-201ENSMUST00000193026 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Mrpl47-201ENSMUST00000043966 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx2P81066 E2f7-204ENSMUST00000173471 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx2P81066 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms