Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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