Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NficP70255 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NficP70255 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NficP70255 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NficP70255 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NficP70255 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
NficP70255 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NficP70255 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NficP70255 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NficP70255 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
NficP70255 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NficP70255 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
NficP70255 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NficP70255 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NficP70255 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms