Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Polr2iP60898 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Polr2iP60898 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Polr2iP60898 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Polr2iP60898 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Polr2iP60898 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Polr2iP60898 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Polr2iP60898 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Polr2iP60898 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Polr2iP60898 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Polr2iP60898 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Polr2iP60898 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms