Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Snap25P60879 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Snap25P60879 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Snap25P60879 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Snap25P60879 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Snap25P60879 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snap25P60879 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Snap25P60879 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snap25P60879 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snap25P60879 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snap25P60879 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms