Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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CartptP56388 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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CartptP56388 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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CartptP56388 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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CartptP56388 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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CartptP56388 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CartptP56388 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CartptP56388 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CartptP56388 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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CartptP56388 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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CartptP56388 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CartptP56388 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CartptP56388 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CartptP56388 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CartptP56388 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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CartptP56388 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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CartptP56388 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CartptP56388 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms