Protein–RNA interactions for Protein: P56203

Ctsw, Cathepsin W, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtswP56203 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CtswP56203 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtswP56203 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtswP56203 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtswP56203 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtswP56203 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtswP56203 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtswP56203 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtswP56203 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtswP56203 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtswP56203 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtswP56203 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtswP56203 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtswP56203 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtswP56203 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtswP56203 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CtswP56203 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CtswP56203 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CtswP56203 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtswP56203 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtswP56203 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms