Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Npy1r-202ENSMUST00000212588 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Ccdc116-202ENSMUST00000115709 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Slc25a45-201ENSMUST00000025732 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 AC154171.3-201ENSMUST00000224519 2505 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Sh3bp1P55194 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
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