Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Abcd3P55096 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Abcd3P55096 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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