Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TspoP50637 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TspoP50637 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TspoP50637 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TspoP50637 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TspoP50637 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TspoP50637 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TspoP50637 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TspoP50637 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TspoP50637 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TspoP50637 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TspoP50637 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TspoP50637 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TspoP50637 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TspoP50637 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TspoP50637 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TspoP50637 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TspoP50637 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TspoP50637 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms