Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms