Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rph3aP47708 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rph3aP47708 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rph3aP47708 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rph3aP47708 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rph3aP47708 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rph3aP47708 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rph3aP47708 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rph3aP47708 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3aP47708 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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