Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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