Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Hoxc11P31313 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms