Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxa10P31310 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms