Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprmP28828 4933405D12Rik-201ENSMUST00000180557 1383 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm15539-201ENSMUST00000118452 566 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm11629-201ENSMUST00000123784 384 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm18783-201ENSMUST00000220465 1151 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 AU015228-201ENSMUST00000121103 1320 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm14538-201ENSMUST00000122019 1327 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Olfr62-201ENSMUST00000102666 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 8430423G03Rik-201ENSMUST00000110507 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Faap24-203ENSMUST00000154597 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 CT025538.1-201ENSMUST00000223638 369 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 AC122459.4-201ENSMUST00000228654 551 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Clpsl2-201ENSMUST00000025061 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Fhl1-206ENSMUST00000116596 1203 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm6665-201ENSMUST00000165131 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm6317-201ENSMUST00000183159 1000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Ints5-203ENSMUST00000191089 568 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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