Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxrgP28705 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.8 ms