Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxraP28700 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxraP28700 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms