Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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TP20293 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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TP20293 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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