Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms