Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18533 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms