Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CtsdP18242 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms