Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms