Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 1110015O18Rik-202ENSMUST00000183944 1533 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm13731-201ENSMUST00000117332 196 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm4473-201ENSMUST00000145987 657 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm26944-201ENSMUST00000182265 633 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm8513-201ENSMUST00000182830 1003 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm43805-201ENSMUST00000198488 824 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Olfr700-202ENSMUST00000214840 1505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm43670-201ENSMUST00000199047 1767 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb4P10284 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms