Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms