Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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DffaO54786 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DffaO54786 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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DffaO54786 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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DffaO54786 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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DffaO54786 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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DffaO54786 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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