Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Edil3O35474 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms