Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4340L7N2C4 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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