Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms