Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4bG5E8Z2 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms