Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms