Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm16252-201ENSMUST00000144420 857 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 1110025M09Rik-201ENSMUST00000192082 855 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm42875-201ENSMUST00000197674 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm29783-201ENSMUST00000219398 369 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 8030423J24Rik-201ENSMUST00000022091 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 4933405D12Rik-201ENSMUST00000180557 1383 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm6665-201ENSMUST00000165131 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm43965-201ENSMUST00000203779 789 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm18783-201ENSMUST00000220465 1151 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Xaf1-204ENSMUST00000146233 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Olfr160-202ENSMUST00000211952 3492 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm16499-201ENSMUST00000204648 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm436-201ENSMUST00000105747 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm17764-201ENSMUST00000185925 391 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm30052-201ENSMUST00000211951 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm28653-202ENSMUST00000227082 521 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm46339-201ENSMUST00000222720 3539 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Ccl6-201ENSMUST00000019071 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm15353-201ENSMUST00000110860 702 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm15539-201ENSMUST00000118452 566 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Wdr17-204ENSMUST00000129132 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm11608-202ENSMUST00000153049 877 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 1700063D05Rik-203ENSMUST00000191461 666 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Btg4-202ENSMUST00000213117 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Tex29-201ENSMUST00000033909 822 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169 ms