Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms