Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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