Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atp8b5A3FIN4 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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