Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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PtprfA2A8L5 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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