Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Hdac5Q9Z2V6 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Hdac5Q9Z2V6 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Hdac5Q9Z2V6 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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