Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms