Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms