Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms