Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms