Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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