Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Alkbh4Q9D8F1 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms