Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmed11Q9D2R4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms