Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef12Q9D2F1 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms