Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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