Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ncbp2Q9CQ49 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ncbp2Q9CQ49 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ncbp2Q9CQ49 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ncbp2Q9CQ49 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ncbp2Q9CQ49 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ncbp2Q9CQ49 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ncbp2Q9CQ49 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ncbp2Q9CQ49 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ncbp2Q9CQ49 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ncbp2Q9CQ49 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ncbp2Q9CQ49 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ncbp2Q9CQ49 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ncbp2Q9CQ49 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ncbp2Q9CQ49 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms